Una de las consecuencias de la renovación espiritual de fines del siglo XII y comienzos del XIII fue una serie de herejías , entre las que destaca la albigense o cátara, de origen maniqueo, extendida principalmente por el Languedoc francés, parte de cuyos territorios pertenecían a la corona aragonesa. Además de la motivación religiosa, en su represión intervinieron otros factores, fundamentalmente políticos, aprovechados por la monarquía francesa para anexionarse estas tierras del sur de Francia. Uno de los perdedores fue el rey aragonés Pedro II , que encontraría la muerte en la batalla de Muret (1213). La herejía se extendió por Aragón y Cataluña, donde buscaron refugio algunos huidos, de modo que Pedro II tuvo que tomar severas medidas contra ellos (1198), lo mismo que Jaime I , que debió permitir la organización en sus dominios de la Inquisición (1232), controlada por dominicos y franciscanos .